Flora y fauna
En la Isla se han reportado 73 especies de aves entre acuáticas y terrestres, entre ellas la reinita (Myoborus melanocephalus), Taminejo (Colibrí coruscans) Robamiel (Diglossa cyanea), Garza Pescadora (Nycticorax nycticorax), Tingla (Fulica ardesiaca), Pato Pico de Oro (Anas Georgia spinicauda) y Pato zambullidor (Oxyura jamaicensis) etc. Se reconocen siete especies de anfibios como Eleuthterodactykus bukleyi, Eleuthterodactykus elassodiscus y Eleuthterodactykus surdus; en mamíferos se reportan ratones silvestres Thomasomys laniger y Aakodon sp. y murciélagos dispersores de semillas como: Sturnira erythromus, polinizadores como Anoura geoffroyi y controladores biológicos como Histiotus montanus También se presenta una alta diversidad de insectos como: mariposas, arañas y hormigas, etc.
El territorio está cubierto en su gran mayoría por bosque primario, es decir, que no ha sido intervenido. Dentro de los árboles nativos se encuentran el cedro, la Ceiba, el Abarco (Cariniana pyriformes, Alrededor del 90% de la vegetación de la isla corresponde a bosque andino en un avanzado estado de regeneración. Posee una estructura vertical heterogénea con diferentes estratos como el rasante, herbáceo, arbustivo y arbóreo. La flora del santuario está representada en más de 300 especies de plantas de 80 familias, algunas de las más representativas son: Asteraceae, Orchidaceae, Bromeliaceae, entre otras. Los árboles característicos de la zona pertenecen a los géneros Weinmannia (Cunoniaceae), Brunellia (Brunelliaceae), Ilex (Aquifoliaceae) y Myrcianthes (Myrtaceae). Las especies sobresalientes por su alto valor en densidad, dominancia y frecuencia son Palicourea flavescens Kunth (Rubiaceae), Weinmannia multijuga Killip & Smith (Cunoniaceae), Hyeronima macrocarpa Müll-Arg (Euphorbiaceae), Saurauia tomentosa (Kunth) Spreng (Actinidiaceae), Anthurium sp. (Araceae), Ilex uniflora Benth (Aquifoliaceae).